Le parquet de Créteil a décidé d’ouvrir une enquête pour « mise en danger de la vie d’autrui ». Elle a été confiée au commissariat local. De son côté, la direction de l’AFSSA a chargé, en application de ses statuts, le CHSCT (comité d’hygiène, de sécurité sur les conditions de travail) de l’établissement, de recueillir tous les éléments sur le dysfonctionnement à l’origine de l’alerte au charbon. Deux erreurs semblent a priori avoir été commises : la première, lors du protocole de stérilisation par mode thermique, qui n’a pas permis de désactiver le bacille.